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信息素养培训视频
讲座主题:单细胞转录组分析简单实践(课件下载
主讲人员:徐洲更,植生所,4年级
讲座内容:单细胞测序技术作为科研领域最新、最热的技术,发展神速。相对于普通转录组而言,目前中文网络上关于单细胞数据分析的资料还不是特别丰富。本次讲座会以目前最常用的单细胞分析软件,Seurat,为切入点,带大家了解下单细胞的分析流程。
讲座主题:Linux文本处理三剑客(课件下载
主讲人员:黄金泉,植生所,博士五年级
讲座内容:本次讲座主要介绍Linux中常用文本处理“三剑客”: grep、sed和awk。简要介绍Linux中正则表达式,并结合科研中经常遇到的文本处理问题进行举例分析,希望能够提高大家的科研效率。
讲座主题:How to analysis ChIP-seq data(课件下载
主讲人员:杨力光,计算所,五年级
讲座内容:How to analysis ChIP-seq data聚焦于ChIP-seq的数据分析,我们将介绍ChIP-seq的技术,分析流程和所需环境,之后我们会从原始数据出发,进行质控和比对,解释peak-calling的原理和实现,并且进行功能分析了解生物学意义。
讲座主题:基于多组学的研究思路(课件下载
讲座主题:RNA-seq流程简介(课件下载
主讲人员:林榕梅,硕博4年级,植生所
讲座内容:转录组分析的实验流程以及生物信息分析流程,注意事项以及可能出现的问题。
讲座主题:高效科研的几个软件/app(课件下载
主讲人员:陈秭如,植物遗传学专业,博士5年级
讲座内容:介绍一些科研工作相关的工具,包括文献订阅、文献管理、知识管理等相关软件/app。
讲座主题:Linux系统基本操作(课件下载
主讲人员:林榕梅,植生所,硕博4年级
讲座内容:介绍Linux基本命令的操作。
讲座主题:Markdown写作入门(课件下载
主讲人员:刘小健,营养与健康研究所,博士一年级
讲座内容:Markdown是一种纯文本格式的轻量级标记语言;作为一种写作语言,它的最高理念是使文档写作、编辑、阅读变得容易和可移植。此次讲座将介绍Markdown基本语法,以及演示基于Windows、Mac OS和Linux平台如何进行Markdown写作。
讲座主题:ChIP-seq概述及分析实战(课件下载
主讲人员:徐春晖,营养与健康院,硕博三年级
讲座内容:ChIP作为研究蛋白质与DNA互作的一个技术结合二代测序以后在极大的范围内拓展了研究的深度,目前应用十分普遍,那ChIP-seq的实现原理和分析流程及后续的可视化又是怎样的呢?本次讲座将基于R语言和Linux系统来介绍ChIP-seq技术的发展、原理、与其他技术的区别、实例分析,你可以通过这次课程基本入门ChIP-seq,并获取深入研究的资源与指导。
讲座主题:复杂生物网络的度量(课件下载
主讲人员:王璐,生化细胞所五年级
讲座内容:生物系统中的不同层面都形成了复杂的网络,包括基因调控网络、细胞相互作用网络等等。 那么建立了网络之后,如何度量和比较它们呢? 此次讲座将介绍基于R和python的网络分析工具,通过计算度和网络熵、稳健性等变量来定量的研究生物网络。
讲座主题:学习R语言进行数据分析(基础篇)(课件下载
主讲人员:徐洲更,硕士3年级
讲座内容:R语言是一套完整的数据处理、计算和制图软件系统。作为一款免费的开源软件,它拥有着良好的社区,有许多软件作者为它开发软件,使其在各个领域大放光彩。本次课程主要介绍R语言的一些基础知识,包括数据结构和数据操作,帮助大家了解这款工具,能够在日后科研工作中用到它。
讲座主题:使用Tableau绘制生物信息图表(课件下载
主讲人员:王璐, 博士2年级
讲座内容:Tableau是世界著名的可视化软件,连续六年被Gartner评为分析软件的领导者,而且对学术使用是免费的
讲座主题:比较基因分析----基因家族分析(课件下载
主讲人员:林榕梅,硕博3年级
讲座内容:基因家族分析流程,相关软件使用简介
讲座主题:Bioconductor Infrastructure by Toy Example(课件下载
主讲人员:黄印,计算生物学,博士四年级
讲座内容:主要介绍IRanges、GenomicRanges和GenomicFeatures三个包,实例讲解它们用于表示,注释和计算基因组的范围
讲座主题:如何基于高通量测序进行变异检测(课件下载
主讲人员:徐洲更,植物遗传学专业,硕士2年级
讲座内容:高通量测序介绍、以及变异检测的分析流程
讲座主题:微生物组图表的解读和绘制(课件下载
主讲人员:王璐,博士2年级
讲座内容:对包括PCoA(PCA)、箱式、韦恩、曼哈顿、火山图在内的图表,在微生物组文献中的应用进行解读,以及使用R语言和Tableau等工具,对以上图表可视化分析
讲座主题:EndnoteX8使用技巧
主讲人员:江晓波,生命科学图书馆
讲座内容:一、建立个人文献库(Library);二、文献库的组织管理;三、利用文献库撰写文章
讲座主题:ggplot2:让数据说话(课件下载
主讲人员:徐洲更,植物遗传学专业,硕士2年级
讲座内容:R语言基础,以及如何使用ggplot2作图
讲座主题:快速定位基因的方法:Mapping by Sequencing(课件下载
主讲人员:陈秭如,植物遗传学专业,博士5年级
讲座内容:Mapping by Sequencing的原理和分析流程
讲座主题:Figures in the Paper科技论文中的图片(课件下载
主讲人员:李叶菲
讲座内容:介绍科技论文中图片的基本要素,不同图片类型的基本要点
讲座主题:R语言中的Bioconductor包介绍及其应用(课件下载
主讲人员:郑广勇,博士,中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所,副研究员
讲座内容:(1)Bioconductor软件介绍(2)Bioconductor软件批量获取数据介绍(3)Bioconductor软件批量生物序列介绍(4)Bioconductor在基因芯片分析中的应用介绍
讲座主题:R语言简介
主讲人员:周露,中科院上海生命科学研究院李亦学组,生物信息学专业,博士四年级
讲座内容:R语言的基础语法、操作和简单的作图
讲座主题:生物信息简介-核算序列的各种处理(课件下载
主讲人员:郑广勇,博士,中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所,副研究员
讲座内容:(1)生物信息学常用数据库介绍(2)核算序列的各种操作介绍(3)BLAST软件安装和操作介绍
讲座主题:lncRNA的计算鉴定与功能推断(课件下载
主讲人员:姚茜岚,上海交通大学生命科学技术学院,生物信息学专业,博士四年级
讲座内容:long non-coding RNA (lncRNA)的生物学背景简介,lncRNA计算鉴定方法以及功能预测

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