生物分子网络的构建和分析 / 刘曾荣[等]著. -- 北京 : 科学出版社, 2012. – (58.178/0284)

Contents

《非线性动力学丛书》序

前言

绪论

  0．1分子生物学简介

  0．2分子系统生物学研究的基本特征

  参考文献

第1章 复杂网络

  1．1复杂系统研究的概况

  1．2生物系统是复杂系统

  1．3网络基础理论

  1．4复杂系统建模——复杂网络

  1．5生物网络特征的简介

  参考文献

第2章 化学反应动力学

  2．1质量作用定律

  2．2酶动力学(enzyme kinetics)

  参考文献

第3章 单调动力系统

  3．1单调动力系统基础

  3．2单调动力系统的动态与分解

  参考文献

第4章 基于生物数据的网络推导

  4．1概述

  4．2转录调控网络

  4．3转录后调控网络

  4．4转录调控网络模体

  4．5常用生物网络分析和可视化软件

  4．6小结

  参考文献

第5章  由进化论构建网络的方法

5．1用DD方法研究生物网络的度负关联性

  5．2 DD方法构建具有综合生物网络特征的模型

  5．3用DD方法构建平均场意义下的生物网络

  参考文献

第6章 基于生物分子网络的知识发现

  6．1网络模体

  6．2生物网络中的分层结构

  6．3基于生物网络的知识挖掘

  参考文献

第7章 细胞信号转导通路：建模和识别

  7．1细胞信号转导

  7．2信号转导网络建模

  7．3基于蛋白质相互作用网络的信号通路识别

  7．4信号途径的应用

  7．5总结

  参考文献

第8章 具有典型动力学性质的生物分子网络介绍

  8．1具有平凡动力学特征的网络

  8．2具有开关效应的网络

  8．3具有振荡效应的网络

  8．4具有可激发性质的网络

  参考文献

第9章 生物分子网络中的调控现象

  9．1基因表达调控

  9．2小RNA调控

  9．3积分控制

  9．4单调控制系统

  参考文献

第10章 一些生命现象的网络分析例子

  10．1细胞周期

  10．2酵母细胞周期网络的离散和连续模型

  10．3酵母细胞周期网络的随机模型

  10．4生物节律

  10．5哺乳动物节律的网络模型

  10．6细胞通信和细胞同步行为研究

  10．7适应性模型

参考文献