生物信息学 / 陈铭主编. -- 2版 . -- 北京 : 科学出版社, 2015. – (58.17115/7487/2版)

Contents

    目 录<br>    
    序<br>    第二版前言
    第一版前言
    第一章 生物信息学的概念及其发展历史1
     第一节 生物信息学的发展历史1
     第二节 生物信息学的研究领域4
     第三节 生物信息学的主要应用5
     第四节 生物信息学面临的挑战9
     思考题10
     参考文献10
    第二章 生物学数据库及其检索11
     第一节 生物学数据库简介11
     第二节 生物学数据库的内容与结构19
     第三节 生物学数据库的检索30
     思考题41
     参考文献4l
    第三章 序列比对原理42
     第一节 序列比对相关概念42
     第二节 序列比对打分方法46
     第三节 序列比对算法51
     第四节 序列比对工具55
     第五节 多序列比对58
     思考题62
     参考文献62
    第四章 蛋白质结构预测与分析64
     第一节 蛋白质结构组织层次64
     第二节 蛋白质结构的测定与理论预测70
     第三节 蛋白质对接84
     第四节 蛋白质折叠与疾病85
     思考题89
     参考文献89
    第五章 真核生物基因组的注释90
     第一节 蛋白质编码基因的注释90
     第二节 RNA基因的注释95
     第三节 重复序列的注释96
     第四节 假基因的注释97
     第五节 案例分析：黄瓜基因组的注释98
     思考题106
     参考文献106
    第六章 蛋白质组学108
     第一节 蛋白质组学概述108
     第二节 蛋白质的大规模分离鉴定技术112
     第三节 蛋白质的翻译后修饰117
     第四节 蛋白质分选118
     第五节 蛋白质相互作用120
     思考题126
     参考文献126
    第七章 系统生物学128
     第一节 系统生物学基本概念128
     第二节 系统生物学基本技术与方法132
     第三节 先进的成像技术135
     第四节 基因表达调控网络140
     第五节 代谢网络143
     第六节 信号转导途径146
     第七节 蛋白质—蛋白质相互作用网络154
     第八节 虚拟细胞164
     思考题164
     参考文献165
    第八章 合成生物学169
     第一节 合成生物学概述169
     第二节 合成生物学基础研究经典实例172
     第三节 合成生物学应用研究经典实例178
     思考题181
     参考文献181
    第九章 分子进化与系统发育183
     第一节 分子进化与系统发育183
     第二节 分子系统发育树的构建方法188
     第三节 系统发育树构建及应用199
     思考题213
     参考文献213
    第十章 统计学习与推理216
     第一节 统计学习与推理基础216
     第二节 统计模型与参数推断220
     第三节 聚类分析、主成分分析与Fisher判别223
     第四节 贝叶斯推理228
     第五节 隐马尔可夫模型230
     第六节 动态神经网络237
     第七节 支持向量机241
     第八节MATLAB的应用实例245
     思考题249
     参考文献249
    第十一章 生物信息学编程基础250
     第一节 Linux操作系统250
     第二节 生物信息学中的编程语言253
     第三节 SQL及数据库编程268
     第四节 并行计算279
     思考题286
     参考文献287
    第十二章 第二代测序技术及其应用288
     第一节 测序技术概述288
     第二节 第二代澳4序原理289
     第三节 第二代测序技术的应用295
     第四节 生物信息学在第二代测序中的应用298
     思考题304
     参考文献305
    彩版