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新书资源(2014年12月)

实时荧光定量PCR / 张惟材,朱力,王玉飞主编. -- 北京 : 化学工业出版社, 2013. – (58.174354 /1294)

Contents

        目 录<br>    
    第一章实时荧光定量PCR概述1
    第一节实时荧光定量PCR的基本原理1
    一、引言1
    二、原理1
    第二节实时荧光定量PCR仪3
    一、Applied Biosystems公司的系列实时荧光定量PCR仪4
    二、iQTM 5实时荧光定量PCR仪4
    三、LightCycler实时荧光定量PCR仪4
    四、SmartCycler System实时荧光定量PCR仪5
    五、Mx3000P实时荧光定量PCR仪5
    六、RotorGene实时荧光定量PCR仪5
    第三节实时荧光定量PCR中的荧光化学物质5
    一、荧光染料5
    二、水解探针6
    三、分子信标7
    四、荧光标记引物9
    五、双探针杂交9
    六、复合探针10
    第四节实时荧光定量PCR的定量方法10
    一、绝对定量10
    二、相对定量12
    第五节实时荧光定量PCR的实验方法16
    一、以DNA为起始实验材料进行实时荧光定量PCR反应17
    二、以RNA为起始实验材料进行实时荧光定量RTPCR19
    第六节实时荧光定量PCR实验中应注意的问题23
    一、扩增子的设计23
    二、实验方案的优化23
    三、实践中应该注意的问题25
    小结26
    本章参考文献27
    第二章实时荧光定量PCR在病原菌检测中的应用29
    第一节沙门菌的检测29
    一、引言29
    二、材料29
    三、方法30
    四、注意事项34
    五、应用35
    六、小结35
    本节参考文献36
    第二节在幽门螺杆菌检测中的应用37
    一、引言37
    二、基本原理37
    三、试验材料37
    四、方法38
    五、注意事项40
    六、应用41
    七、小结42
    本节参考文献42
    第三节在致病性大肠杆菌检测中的应用43
    一、检测DNA样品中fliCH7基因的Realtime PCR方法43
    二、检测RNA样品中rfbE和eae基因的Realtime PCR方法44
    本节参考文献47
    第四节在肉毒梭菌检测中的应用47
    方案一SYBR Green Ⅰ Realtime PCR方法检测A型肉毒梭菌47
    一、引言47
    二、原理48
    三、实验目的48
    四、实验材料和方法48
    五、实验结果50
    六、讨论51
    方案二用TaqMan Realtime PCR对A型、B型和E型肉毒梭菌的检测51
    一、引言51
    二、原理51
    三、实验目的52
    四、实验材料和方法52
    五、实验结果53
    六、讨论54
    方案三TaqMan Realtime PCR 在肉毒梭菌C型毒素基因检测中的应用54
    一、引言54
    二、原理55
    三、实验目的55
    四、实验材料和方法55
    五、实验结果56
    六、讨论56
    本节参考文献56
    第五节在嗜水气单胞菌检测中的应用57
    一、引言57
    二、材料57
    三、方法58
    四、应用59
    本节参考文献60
    小结60
    第三章实时荧光定量PCR在病毒检测中的应用62
    第一节实时荧光定量RTPCR在甲型H1N1检测中的应用62
    一、引言62
    二、试验目的63
    三、材料与试剂63
    四、试验方法64
    五、结果判定67
    六、注意事项68
    七、小结69
    本节参考文献69
    第二节登革病毒的实时荧光定量RTPCR检测69
    一、引言69
    二、试验目的70
    三、材料与试剂70
    四、操作步骤71
    五、注意事项73
    本节参考文献74
    第三节H5N1亚型高致病性禽流感病毒的实时荧光定量RTPCR检测74
    一、引言74
    二、试验目的75
    三、材料与试剂75
    四、操作步骤76
    五、试验结果判定77
    六、注意事项78
    本节参考文献78
    第四节肠道病毒71型的实时荧光定量RTPCR检测78
    一、引言78
    二、试验目的79
    三、材料与试剂79
    四、操作步骤80
    五、结果分析80
    六、注意事项81
    本节参考文献81
    第五节多重实时荧光定量PCR在呼吸道病毒检测中的应用81
    一、引言81
    二、试验目的82
    三、材料与试剂82
    四、试验原理与方法82
    五、结果判定85
    六、注意事项85
    七、小结88
    本节参考文献88
    第六节实时荧光定量PCR用于重组杆状病毒滴度检测的研究89
    一、引言89
    二、试验目的89
    三、材料89
    四、方法89
    五、结果及分析91
    六、注意事项92
    七、小结93
    本节参考文献93
    第七节实时荧光定量PCR在HIV检测中的应用94
    一、引言94
    二、基本原理94
    三、试验材料95
    四、方法95
    五、试验结果判定97
    六、注意事项97
    七、应用98
    本节参考文献98
    第八节在检测HBV和HCV方面的应用99
    A 实时荧光定量PCR在检测HBV方面的应用99
    一、引言99
    二、材料和方法100
    三、小结108
    B实时荧光定量PCR在检测HCV方面的应用109
    一、引言109
    二、材料和方法110
    三、小结114
    本节参考文献116
    第四章实时荧光定量PCR检测基因突变及临床应用122
    第一节实时荧光定量PCR检测基因突变在遗传病诊断中的应用122
    一、引言122
    二、应用巢式PCR和TaqMan MGB探针Realtime PCR技术检测经典型苯丙酮尿症(PKU)125
    三、应用SYBR Green Ⅰ Realtime PCR技术检测慢性骨髓增殖性疾病127
    第二节实时荧光定量PCR检测基因突变在肿瘤诊断、治疗和预后中的应用130
    一、引言130
    二、应用ASBPCR方法检测Kras基因突变132
    第三节实时荧光定量PCR检测基因突变在耐药病原体监测中的应用135
    一、引言135
    二、通过杂交探针实时荧光定量PCR检测临床分离的结核分枝杆菌的异烟肼抗性135
    三、FRET实时荧光定量PCR快速准确检测幽门螺杆菌耐克拉霉素相关的基因点突变137
    本章参考文献140
    第五章实时荧光定量PCR在遗传病研究中的应用141
    第一节实时荧光定量PCR识别SNP的方法141
    一、原理141
    二、常用的突变识别方法142
    本节参考文献145
    第二节实时荧光定量PCR在SNP分型中的应用145
    一、引言145
    二、试验目的146
    三、试验原理146
    四、试验材料146
    五、试验方法146
    六、结果与讨论149
    本节参考文献150
    第三节等位基因特异性实时荧光定量PCR在DNA库中等位基因定量检测中的应用150
    一、引言150
    二、试验目的150
    三、试验原理150
    四、试验材料151
    五、实验方法151
    六、结果与讨论154
    本节参考文献155
    第四节等位基因特异性PCR结合分子信标实时荧光定量PCR在肿瘤和线粒体疾病检测中的应用155
    一、引言155
    二、试验目的156
    三、试验原理156
    四、试验材料156
    五、试验方法156
    六、结果与讨论158
    本节参考文献158
    第六章实时荧光定量PCR在肿瘤中的应用160
    第一节实时荧光定量PCR在肿瘤早期诊断中的意义160
    方案1Pescadillo在乳腺癌组织中的表达及其临床意义161
    一、试验目的161
    二、基本原理161
    三、实验材料161
    四、实验方法161
    五、实验结果163
    六、小结164
    方案2实时荧光定量PCR检测microRNA在不同肿瘤细胞中的表达164
    一、实验目的164
    二、基本原理164
    三、材料164
    四、方法165
    五、结果165
    六、小结167
    第二节实时荧光定量PCR在肿瘤预后评估中的应用167
    方案1实时荧光定量PCR检测uPA、PAI1、TIMP1 mRNA表达与乳腺癌预后的关系167
    一、实验目的167
    二、实验材料168
    三、实验方法168
    四、实验结果169
    五、小结172
    方案2实时荧光定量PCR检测uPA mRNA表达在HER2阳性乳腺癌预后中的意义172
    一、实验目的172
    二、实验材料173
    三、实验方法174
    四、实验结果175
    五、小结177
    第三节实时荧光定量PCR在药物疗效判断中的作用178
    一、实验目的178
    二、材料178
    三、方法179
    四、结果181
    五、小结183
    第四节实时荧光定量PCR在基因表达调控中的应用183
    一、实验目的183
    二、实验材料183
    三、实验方法183
    四、实验结果184
    五、小结187
    本章参考文献187
    第七章实时荧光定量PCR在环境微生物检测中的应用191
    第一节实时荧光定量PCR在检测土壤微生物中的应用191
    一、引言191
    二、试验目的191
    三、原理191
    四、土壤微生物DNA提取方法汇总192
    五、操作步骤195
    六、实时荧光定量PCR在土壤中病原菌定量检测中的应用198
    七、实时荧光定量PCR在土壤中生防菌的动态变化监测中的应用200
    本节参考文献200
    第二节实时荧光定量PCR 技术在空气微生物检测中的应用201
    一、引言201
    二、试验目的201
    三、试验材料与方法202
    四、小结208
    本节参考文献208
    第三节实时荧光定量PCR在检测水源微生物方面的应用208
    一、引言208
    二、基本原理209
    三、研究进展210
    四、实验方法211
    五、实验结果213
    六、结果分析214
    本节参考文献215
    第八章实时荧光定量PCR在动物学研究中的应用217
    第一节实时荧光定量PCR在动物感染性疾病监测和检测中的应用217
    一、引言217
    二、原理217
    三、材料218
    四、方法与步骤218
    五、注意事项220
    六、应用221
    本节参考文献221
    第二节实时荧光定量PCR在转基因动物检测中的应用222
    一、引言222
    二、原理223
    三、材料223
    四、方法与步骤223
    五、注意事项225
    六、应用226
    本节参考文献227
    第三节实时荧光定量PCR在突变动物检测和突变品系培育中的应用228
    一、引言228
    二、SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR在HLA1502基因检测中的应用228
    三、实时荧光定量PCR在白化突变鼠检测中的应用230
    四、注意事项232
    五、应用233
    本节参考文献234
    第四节实时荧光定量PCR在药物效果评价动物实验中的应用235
    一、引言235
    二、实时荧光定量PCR在马传染性贫血病毒疫苗效果评价中的应用236
    三、利用实时荧光定量PCR评价以离子交换色谱纯化抗体时外源病毒因子的清除效果238
    四、注意事项240
    五、应用241
    本节参考文献243
    第九章实时荧光定量PCR在基因表达检测和流行病学中的应用244
    第一节实时荧光定量PCR在分析基因差异表达中的应用244
    一、实时荧光定量PCR实验的设计和优化244
    二、实时荧光定量PCR应用实例246
    三、实验注意事项249
    四、小结250
    本节参考文献250
    第二节实时荧光定量PCR检测CAR基因在小鼠肺发育不同阶段中的表达250
    一、引言250
    二、材料及方法251
    三、数据分析254
    本节参考文献255
    第三节实时荧光定量PCR在流行病学中的应用255
    一、微生物的检测和鉴定256
    二、耐药分析256
    三、DNA甲基化、单核苷酸多态性及突变分析257
    四、肿瘤基因检测257
    五、基因表达差异分析258
    六、微生态中微生物种的相对定量258
    本节参考文献259