细胞的物理生物学 / (美)R.菲利普斯, (美)J.康德夫, (美)J.塞里奥特著 ; 涂展春, 王伯林 ... 等译. —— 北京 : 科学出版社, 2012. – (58.1571/4428) |
Contents
目 录<br>
第一篇 生物系统的基础知识
1生物学定量模型3
1.1细胞的物理生物学3
1.2生命的要素4
1.3生物学建模9
1.4定量模型及理想化方法18
1.5总结24
1.6延伸阅读25
1.7参考文献26
2细胞和生物体的空间尺度和构造方案27
2.1剖析大肠杆菌27
2.2细胞及其内部结构38
2.3多细胞层次的结构和功能57
2.4总结
2.5课后习题
2.6延伸阅读
2.7参考文献<br> 3生命系统的时间尺度<br> 3.1时间尺度的层级性<br> 3.2程序时间
3.3相对时间
3.4操控时间
3.5总结
3.6课后习题
3.7延伸阅读
3.8参考文献<br> 4模式系统
4.1模式系统的选择
4.2、血红蛋白<br> 4.3噬菌体<br> 4.4大肠杆菌
4.5酵母
4.6果蝇
4.7小鼠和人
4.8特型系统
4.9总结
4.10课后习题
4.11延伸阅读
4.12参考文献<br> 第二篇 从平衡态角度理解生命<br> 5活细胞中的力学和化学平衡
5.1能量和细胞生命活动<br> 5.2从自由能极小化角度理解生物系统<br> 5.3极值数学<br> 5.4构型能<br> 5.5自由能极小状态对应的结构
5.6总结
5.7附录:欧拉一拉格朗日方程
5.8课后习题
5.9延伸阅读
5.10参考文献<br> 6统计力学基础与简单应用<br> 6.1玻尔兹曼分布
6.2无相互作用的理想模型
6.3质量作用定律
6.4平衡态演算的应用
6.5总结
6.6课后习题
6.7延伸阅读
6.8参考文献<br> 7二态系统<br> 7.1多态的高分子<br> 7.2受体一配体结合的态变量描述<br> 7.3总结
7.4课后习题
7.5延伸阅读
7.6参考文献<br> 8无规行走和高分子结构
8.1高分子结构的确定性和统计性描述<br> 8.2用无规行走描述高分子
8.3单分子力学的新世界<br> 8.4通过无规行走理解蛋白质折叠-
8.5总结
8.6课后习题
8.7延伸阅读
8.8参考文献<br> 9盐溶液的静电学<br> 9.1水是生命的以太<br> 9.2水的化学
9.3盐溶液的静电学313
9.4总结
9.5课后习题332
9.6延伸阅读335
9.7参考文献336
10弹性梁理论及其生物学应用337
10.1细胞中存在大量的梁结构337
10.2梁变形的几何和能量338
10.3转录调控的力学346
10.4 DNA的包装350
10.5细胞骨架与弹性梁理论364
10.6梁与生物技术372
10.7总结375
10.8附录:虫链模型的数学375
10.9课后习题377
10.10延伸阅读380
10.11参考文献381
11生物膜的弹性382
11.1生物膜的性质382
11.2膜的弹性392
11.3囊泡的结构、能量和功能400
11.4膜及其形状<br> 11.4.1细胞器的形状411
11.4.2细胞的形状414
11.5活性膜415
11.6总结
11.7课后习题423
11.8延伸阅读426
11.9参考文献427
第三篇 从动力学角度理解生命
12流体力学
12.1水的地位
12.2水和其他流体的动力学
12.3血液流体动力学
12.4低雷诺数的世界<br> 12.5总结
12.6课后习题
12.7延伸阅读
12.8参考文献<br> 13扩散
13.1胞内的扩散运动<br> 13.2浓度场与扩散动力学<br> 13.3扩散理论的简单生物学应用474
13.4总结479
13.5课后习题479
13.6延伸阅读480
13.7参考文献481
14无序与拥挤环境中的生命482
14.1拥挤、连锁和纠缠482
14.2拥挤环境中的平衡488
14.2.4聚合物的排斥体积效应498
14.3拥挤动力学501
14.4总结
14.5课后习题504
14.6延伸阅读506
14.7参考文献506
15速率方程与胞内的动力学508
15.1生物统计动力学初探508
15.2生物动力学的化学图像.513
15.3细胞骨架的动态构建533
15.4细胞骨架聚合生长的简单模型537
15.5总结553
15.6课后习题554
15.7延伸阅读555
15.8参考文献556
16分子马达动力学557
16.1分子马达简介557
16.2整流的布朗运动572
16.3聚合和易位也是马达运动595
16.4总结
16.5课后习题608
16.6延伸阅读610
16.7参考文献611
17生物电和霍奇金.赫胥黎模型613
17.1电在细胞中的角色613
17.2细胞的电荷状态614
17.3膜的通透性616
17.4动作电位623
17.5总结640
17.6课后习题640
17.7延伸阅读641
17.8参考文献642
第四篇 从信息的角度理解生命
18序列、特异性和进化645
18.1生物信息645
18.2序列联配和同源性648
18.3序列与进化662
18.4保真度的分子基础671
18.5总结677
18.6课后习题677
18.7延伸阅读680
18.8参考文献681
19网络的时空组织683
19.1细胞中的化学和信息组织683
19.2基因网络688
19.3调控动力学706
19.4信号转导718
19.5总结726
19.6附录:基因开关的稳定性分析727
19.7课后习题728
19.8延伸阅读730
19.9参考文献731
20面向未来的物理生物学733
20.1定量数据需要定量模型733
20.2正确对待出错735
20.3量级生物学与计算模拟736
20.4理论上的困难737
20.5读者的任务741
20.6延伸阅读741
20.7参考文献742
索引743
译后记764