生物信息学中计算机技术应用 / 陈绮编著. —— 北京 : 电子工业出版社,2010. – (58.17115/7424) |
Contents
目 录<br>
第1章 绪论
1.1 引言
1.2 生物信息学<br> 1.2.1 生物信息学产生的背景
1.2.2 生物学数据库
1.2.3 生物信息学的主要研究内容
1.2.4 与生物信息学关系密切的数学领域<br> 1.2.5 与生物信息学密切相关的计算机科学技术<br> 1.2.6 生物信息学工业<br> 1.3 生物信息学中的计算机技术应用<br> 1.4 蛋白质结构模型<br> 1.5 生物系统背景知识
1.6 本书研究的内容<br> 1.7 本书的组织结构<br> 1.8 本章小结
第2章 生物信息学中的结构比较<br> 2.1 结构比对(Structure Alignment)
2.2 VAST与DALI
2.3 全局与局部结构比较<br> 2.4 利用数学记号进行结构比较
2.5 生物大分子表面结构的比较
2.6 本章小结
第3章 三维结构比较
3.1 三维结构比较研究
3.2 基于体模型的比较
3.2.1 外形特点分析
3.2.2 特征提取与匹配<br> 3.3 基于三维模型几何相似性的比较
3.3.1 基于轮廓的几何相似性比较算法<br> 3.3.2 基于拓扑结构的几何相似性比较算法<br> 3.3.3 基于视觉的几何相似性比较算法<br> 3.4 三维模型相似性度量方法的分类
3.5 本章小结
第4章 蛋白质三维结构可视化
4.1 蛋白质存储结构分析<br> 4.2 PDB文件中对于大分子结构的描述<br> 4.3 MATLAB下蛋白质三维结构可视化实现<br> 4.4 本章小结
第5章 建立蛋白质三维结构频谱<br> 5.1 三维物体形状特征提取
5.2 统一坐标系的建立
5.3 小波分析
5.4 基于蛋白质碳原子距离的多分辨频谱建立
5.5 基于统一坐标序列的蛋白质三维结构多分辨频谱建立<br> 5.6 本章小结
第6章 蛋白质三维结构相似性<br> 6.1 三维模型相似性比较<br> 6.2 灰色系统理论概述
6.3 蛋白质三维结构相似性的灰色关联分析
6.3.1 原理与方法<br> 6.3.2 实验结果及讨论<br> 6.4 蛋白质三维结构频谱的灰色关联分析
6.4.1 方法与步骤<br> 6.4.2 实验结果及讨论<br> 6.5 本章小结
第7章 蛋白质三维结构空间复杂性<br> 7.1 生物学中的分形<br> 7.2 分形的概述<br> 7.3 基于分形的蛋白质三维空间结构复杂性研究<br> 7.3.1 原子覆盖法的碳骨架分维数计算
7.3.2 实验结果及讨论<br> 7.4 基于结构频谱分维的蛋白质三维结构相似性比较<br> 7.4.1 方法与步骤<br> 7.4.2 实验结果及讨论<br> 本章小结
第8章 蛋白质三维结构视图系统171
8.1 系统框架
8.2 系统功能
8.3 本章小结
后记
参考文献<br>