免疫信息学 : 计算机辅助预测免疫原性 / (英)D. R. 弗劳尔(Darren R. Flower)主编 ; 吴玉章 ... [等] 译. —— 北京 : 科学出版社, 2010. – (58.6911/5542) |
Contents
目 录<br>
译者序
前言
1免疫信息学与计算机辅助预测免疫原性:导论l
第1部分 数据库<br> 2国际免疫遗传学信息系统(IMGT) 10
3 IMGT/HLA数据库27
4免疫多态性数据库:IPD 39
5 T细胞表位查询和预测数据库:SYFPEITHI 49
6 T细胞表位、MHC结合肽和TAP结合肽的搜寻及描图61
7 Bcipep数据库中B细胞表位的搜寻及描图75
8半抗原、载体蛋白和抗半抗原抗体的检索84
第2部分 HLA超型鉴定
9基于GRID/CPCA和层次聚类法的HLA超型分类95
10 HLA-A2超型的结构基础104
11基于MHC结合肽库定义MHC超型110
12基于肽结合凹槽静电分布图的HLA-I类等位基因分型117
第3部分 肽与MHC结合能力的预测<br> 13特征参数法预测MHC结合肽123
14机器学习技术预测MHC结合肽133
15人工智能方法预测T细胞表位144
16小鼠MHC—多肽亲和力的预测150
17 3D-QSAR模型预测MHC-多肽亲和力164
18基于MHC分子模型预测表位肽175
19基于支持向量机预测MHC结合肽182
20应用SVRMHC方法预测多肽与MHC分子的结合亲和力189
21基于结构及分子模拟预测HLA结合肽195
22基于结构预测MHC结合肽操作指南200
23 MHC-I及MHC-II与肽结合的静态能分析206
24分子动力学模拟214
25一种预测MHC-II类分子结合肽的迭代方法229
26 MHC-II类分子结合肽综合预测方法237
27基于贝叶斯神经网络的MHC-II类分子—肽复合物非线性预测模型244
第4部分 免疫系统其他特性的预测
28 TAPPred法预测抗原中的TAP结合肽253
29 B细胞表位的预测方法257
30一种MHC分子结构功能相似性分析平台:HistoCheck 263
3l免疫相关性毒力因子的预测271
索引278
彩图