分子生物学软件应用 / 刘旭光, 张杰编著.——北京 : 北京大学医学出版社,2007.—(58.178056/0249)

Contents

    目 录<br>    
    第一部分 核酸序列分析
    1 序列检索与格式转换 3
    1．1 序列检索 3
    1．2 序列格式简介 7
    1．3 格式转换 16
    2 一级结构分析 23
    2．1 组成成分分析 23
    2．2 重复序列 27
    2．3 序列变换 29
    3 克隆 33
    3．1 酶切位点查找 33
    3．2 模拟电泳 47
    3．3 电泳图像分析 52
    3．4 质粒绘图 57
    3．5 克隆策略与过程显示 67
    4 引物设计 70
    4．1 引物设计的基本原则 70
    4．2 引物设计与分析 74
    4．3 高通量引物与探针设计106
    5 测序拼装 111
    5．1 测序图分析 111
    5．2 测序拼装 115
    6 DNA功能分析 122
    6．1 ORF查找与翻译 122
    6．2 Motif查找 135
    7 RNA二级结构预测 138
    7．1 RNAstructure 138
    7．2 RNAdraw 142
    7．3 DNAstar 145
    第二部分 蛋白质序列分析<br>    1 理化性质分析
    1．1 蛋白酶酶切特性<br>    1．2 滴定曲线与等电点
    1．3 亲水性和疏水性<br>    1．4 电荷密度
    2 二级结构预测
    2．1 DNAstar
    2．2 Vector NTI Advance
    2．3 ANTHEPROT
    3 其他特殊局部结构分析<br>    3．1 膜蛋白的跨膜螺旋
    3．2 信号肽<br>    3．3 卷曲螺旋
    3．4 抗原决定簇<br>    4 三维分子显示
    4．1 RasMol
    4．2 Vector NTI Advance
    4．3 Cn3D
    第三部分 序列比对及进化树
    1 BLAST
    1．1 BLAST简介<br>    1．2 BLAST实践
    1．3 BLAST高级选项
    2 本地BLAST
    3 多序列之间的两两比对与进化树分析
    3．1 C1ustalX
    3．2 DNAstar
    3．3 Vector NTI Advance
    3．4 PHYLIP
    第四部分 文献管理与引用<br>    1 文献管理
    1．1 Reference Manager
    1．2 EndNote
    1．3 NoteExpress
    1．4 全文查找
    2 在Word中引用文献<br>    2．1 Reference Manager
    2．2 EndNote
    2．3 NoteExpress
    附录l 软件简介<br>    附录2 参考文献<br>